마이크로바이옴 공부 교재

Bioinformatic and Statistical Analysis of Microbiome Data

- 저자: Yinglin Xia,  Jun Sun

- 출판사: Springer

- 출판일: 2023-05-17

- 원서 가격:  339,980원 (진짜 후덜덜 하다)

 

 

목차

1. QIIME2 소개 
2. 마이크로바이옴 데이터를 위한 R 소개
3. QIIME2에서 기본적인 데이터 처리
4. Raw 데이터로 부터 Feature와 Feature table만들기
5. assigning taxonomy와 계통수 제작
6. 서열을 OTU로 군집화 하기 
7. OTU methods
8. OTU methods그 이상 
9. alpha diversity
10. Beta diversity
11. Beta diversity를 위한 통계분석 방법
12. 마이크로바이옴 데이터를 위한 차등 풍부 분석(DAA)
13. 마이크로바이옴 데이터를 위한 zero inflated bate model
14. 마이크로바이옴 데이터의 상대적 분포 분석
15. 종단적인 마이크로바이옴 데이터 분석을 위한 선형 mixed effect model
16. 일반적인 선형 mixed effect model
17. 종단적인 마이크로바이옴 데이터 분석을 위한 일반적인 선형 mixed effect model
18. 다변량 종단 마이크로바이옴 모델

이 책을 가장 기본 전공책으로 삼으면 좋을듯, 하루에 하나씩 적용해봐야겠다.