Fold change와 p-value의 차이

Bioinformatics/기타

김해김씨99대손 2022. 10. 11. 20:02

[RNA-seq Data 결과 해석]

Fold change > 0 : 발현 증가

Fold change < 0 : 발현 감소

P-value : 분포 양상이 통계적으로 유의하게 차이가 나는지 ( p-value < 0.05 -> 유의)

Fold change는 크기 비교이며, FDR/P-value는 분포 비교이다.

예시 이미지로 간단하게 이해해 보자.

WT(Wild Type)과 KO(Knock Otu)타입을 비교한 데이터이다.

각각 이미지에서 평균 값의 차이는 같지만, 분포양상(분산)이 다르다.

각 값의 Fold change 값이 같을 때,

위는 p value 작으며, 아래는 p value가 크다. 왜 그런가?

이는 분포가 좁은 WT과 KO 타입에서 각 값들이 우연히 겹칠 확률이 작기 때문에 p-value값이 작다.

어느정도 정규분포에 가까운 값을 얻을 수 있기 때문이다.