[스크랩] 벤다이어그램과 비슷한 Upset plot

- Tutorial : https://krassowski.github.io/complex-upset/articles/Examples_R.html

Examples - R

 

- 관련 패키지 : https://yulab-smu.top/MicrobiotaProcessWorkshop/articles/MicrobiotaProcessWorkshop.html

Workshop of microbiome dataset analysis using MicrobiotaProcess

 

 

- 시각화 예시 

Hinsu, A.T., Tulsani, N.J., Panchal, K.J.  et al.  Characterizing rumen microbiota and CAZyme profile of Indian dromedary camel ( Camelus dromedarius ) in response to different roughages.  Sci Rep   11 , 9400 (2021). https://doi.org/10.1038/s41598-021-88943-9

각 그룹간 공통적으로 공유하는 taxa 가 제일 왼쪽(노란색 바) 이며 다른 군은 모든 그룹에서 공유하고 있지는 않음

=> 요즘 많이 나오는 Core microbiome을 나타내려고 할때 사용하는것 같다.