| Error
Error in check_rank_names(ps) :
ranks of taxonimic profile must be one of Kingdom, Phylum, Class, Order, Family, Genus, Species
| Error 해결
phyloseq::rank_names(your_ps)위 문구로 현재 본인의 phyloseq개체가 어떤 tax rank를 가지고 있는지 판단하자.
단순히 여기서 Kingdom, Phylum, Class, Order, Family, Genus, Species외의 추가적인 rank가 있다면 삭제하면 된다.
TAX<- tax_table(your_ps) %>% data.frame()
tax_table(your_ps) <- tax_table(as.matrix(TAX[,c("Kingdom", "Phylum", "Class", "Order", "Family", "Genus", "Species")]))
rank_names(your_ps)
| 참고
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