metagenome

- 작성 일시 : 2023-03-06 ~ 2023-03-21 🟦 1. 마이크로바이옴 데이터에서 기능 예측의 필요성 | Shotgun Metegenome vs. Amplicon - 금액적 차이 : 미생물 유전체의 전체를 조사하는 Shotgun metagenome 시퀀싱은 약 30$, 16S rRNA(Amplicon)의 시퀀싱 가격은 약 5$ 이하이다. - 분석 차이 : Shotgun 은 많은 컴퓨팅 파워를 필요로 하고, 샘플의 모든 유전체를 읽어옴으로 사람의 미토콘드리아 데이터가 많이 읽히는 단점이 있다. Amplicon은 일부 마커진을 이용한 계통 정보는 알 수 있지만, 해당 미생물의 전체적인 기능에 대한 정보는 얻을 수 없다. | 기능 예측 프로그램의 필요성 - 가격적인 면에서 Shotgun를 수행하지..

- 일시 : 2023.02.08(수) - 장소 : 서울대학교 자연과학관 26동 B102호 - 수강 강의 : Human Microbiome Studies with Bioinformatics Approaches (이선재 교수님/GIST) ⬛ 등록 Type Annual Membership Fee Early Registration (~Feb.03) On-Site Registration (Feb.06~ Feb.08) Member Student ₩ 40,000 ₩ 120,000 ₩ 170,000 Ac/Gov/Non-Profit ₩ 80,000 ₩ 150,000 ₩ 200,000 Industry ₩ 50,000 ₩ 200,000 ₩ 250,000 Non-member Student - ₩ 180,000 ₩ 230,00..

- 저자 : Ruairi Robertson, PhD - 출처 : https://blog.microbiomeinsights.com/shotgun-metagenomic-sequencing-determining-depth Shotgun Metagenomic Sequencing: Determining Depth Before conducting a microbiome study with shotgun metagenomic sequencing, it is important to consider how deeply you will sequence your samples. blog.microbiomeinsights.com ※ 이 글은 microbiome insights사의 "Shotgun Metagenomic Sequ..