[Cutadapt] 01.Linux에 Cutadapt 4.2 ver 설치하기

🟦 공식 가이드 

https://cutadapt.readthedocs.io/en/stable/installation.html

Installation — Cutadapt 4.2 documentation

 

설치방법은 크게 pip를 이용한 다운과 conda를 이용한 다운이 있다.

아래 스크립트를 보고 쉽게 다운로드가 가능하다.

 

 

🟦 설치하기 

Conda

# conda install
conda create -n cutadaptenv cutadapt
	# cutadaptenv = conda상의 cutadapt를 실행하는 환경 이름, 원하는 이름으로 바꾸어도 됨

# conda에서 cutadaptenv환경 실행하기
conda activate cutadaptenv

# 실행됐는지 확인
cutadapt --version

 

PIP

# 다운로드
sudo apt install python3-virtualenv
	# centos의 경우 sudo yum install ~

# Cutadapt를 실행 할 가상 환경 생성 
virtualenv ./cutadapt-venv
./cutadapt-venv/bin/pip --upgrade pip
./cutadapt-venv/bin/pip install cutadapt
	# 가상 환경에 cutadapt설치하기 

# 직접 경로를 이용해 설치 확인 
./cutadapt-venv/bin/cutadapt --version

# 혹은 가상 환경을 실행해서 이용하기 
source cutadapt-venv/bin/activate
cutadapt --version

 

Debian/Ubuntu

sudo apt install cutadapt
# 혹은 -> sudo apt install python3-cutadapt

 

삭제하기 

pip3 uninstall cutadapt

 

 

 

 

Centos7.9를 사용하고 있는데, Conda를 이용한 설치가 오류가 나서 pip를 통한 설치를 진행했다.

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