🙋♀️안녕하세요. 김해김 씨 99대손입니다.오늘은 생명정보학을 공부하는 분들, 특히 컴퓨터를 대학원에 와서 익히게 된 생명과학 전공자들에게 꼭 들려주고 싶은 이야기를 정리해 보았습니다. 1. 생명정보학자들이 왜 소프트웨어 개발 원칙을 이해해야 하는가?10년 차 생명정보학 재직자의 레딧 글이 단 시간에 500개의 upvote를 받았습니다. 글의 내용은 왜 아직도 생명 정보학은 다른 분야에 비해 초기에 머물러 있는지를 논의하고 있습니다. (https://www.reddit.com/r/bioinformatics/comments/1l3t6b7/bioinformatics_is_still_in_its_infancy/) "생물정보학은 아직 초기 단계입니다." 왜 생물정보학은 아직 초기 단계일까? 작..
◼ 출처 - 2006 한국 생물 정보학 백서, 부록9 생물 정보학 관련 용어 및 정의 (생물학연구정보센터) ◼ 지필 - 생물학연구정보센터 소 장 : 김상욱 - 생물학연구정보센터 부소장 : 정동수 - 생물학연구정보센터 연구원 : 김수정, 박지민, 유숙희, 이강수 장영옥, 조점희, 최용주, 한건영 ◼ 링크 : https://ibric.org/myboard/read.php?id=2337&Board=report 2006 한국의 생물정보학 백서 - 목 차 -제1장. 연구단체 11. BIT 연구기관협의회 32. 바이오벤처 453. 대학 994. 연구센터 1175. 학회... ibric.org - 2006년 판이라 용어가 조금 다르거나, 오래된 프로그램 혹은 변동된 내용이 존재함. 그러나 매우 유익하다. - 2006..
생물정보학 분야를 전공하기로 마음먹었는데 나는 생물정보학, 전산생물학 과가 아니며, 아직 학부생이다! 뭘 해야하지? 라고 생각될때 도움이 될만한 글을 가져왔습니다. 출처 : 생물 정보학은 아주 넓은 범위의 필드를 포함한다. 일반적으로 생물정보학자는 생물학 데이터의 분석을 위한 컴퓨터공학적 기술을 사용해야 한다. QnA Q . Isn’t this kind of like data science? 생물정보학자는 데이터 과학자의 한 종류가 아닌가요? A. 네 맞습니다. 생물정보학은 생물학적 데이터 과합입니다. 다른점은 생물정보학은 생물적, 의학적 응용에 초점을 맞춘것 입니다. Q. How do I become a bioinformatician? 생물정보학자가 되려면 어떻게 해야 할 까요? A. 생명과..
alignment, mapping, assembly는 결국 유전제 조각을 이어 붙이는 목적에서는 3개 다 같은 뜻 같지만 사용적인 측면이 조금 다른것 같아 정리 해보았습니다! 각 단어가 사용될때 "sequence alignment", "read mapping" and "sequence assembly"으로 사용 됩니다. 정의 1) sequence alignment Alignment는 nucleic acids or aminoacids의 서열 비교이다. 예를 들어 아래 두 서열의 데이터를 가지고 있을때 ABCDEFGHIPQRSVXZ ACCHJKLPQTXYZ 두 서열을 align하는 것은 비슷한 특징(features)를 가졌는지 보는것이다 결과는 아래처럼 나온다. ABCDEFGHI---PQRSVX..