MEGA

| 계통수 시각화 프로그램 중 가장 많이 사용되는 Top 5 계통수 파일이 형식은 대부분의 소프트웨어에서 사용 가능하다. 정말 많은 도구가 있지만 그중에서 가장 널리 쓰이는 5개의 툴을 가지고 왔다. 아래 예제데이터인 phyloseq의 계통수를 가지고 각 프로그램으로 계통수를 그려보자. 예제 데이터는 qiime2의 moving-picture 데이터를 phyloseq개체로 변환한 것이다. library(ape) library(phyloseq) ps
수정 : 2023-04-16 프로그램에 관한 사용법임으로 분류 알고리즘에 대한 설명은 생략하겠습니다. 1. 다운로드 및 설치 - MEGA 다운로드 링크 : https://www.megasoftware.net/ MobaXterm_Installer_v22.1 압축 풀기 MobaXterm_Installer_v22.1 더블클릭 -> 모두 Yes -> 설치 완료 2. 예제 파일로 계통수 그리기 1) FASTA format으로 저장하기 "내 PC\문서"를 가면 "MEGA X" 폴더가 만들어진 것을 볼 수 있습니다. 그 안의 "Examples"폴더에 들어가면 MEGA프로그램 사용법을 익히기 위해 추가적으로 다운된 샘플들의 fasta파일들을 볼 수 있습니다. "MEGA X\Example\NeiKumar2000" 폴더에..