[Rosalind] Counting Point Mutations (Python/R)

2023.06.07 R 풀이 추가 

 

 

https://rosalind.info/problems/hamm/

(이 전의 문제를 풀어야만 풀이가 가능합니다)

 

 

| Problem

같은 길이의 두 DNA 서열이 주어질때 각기 서로 다른서열의 자릿수는 어떠한가?

 

| 예제 데이터와 결과 

• Sample Dataset

GAGCCTACTAACGGGAT
CATCGTAATGACGGCCT

• Samplpe output 

7

 

 

 

| Python

내 풀이

with open('rosalind_hamm.txt', 'r') as f : 
    s = f.readline()
    t = f.readline()
    
count = 0
for i in range(len(s)) :
    if s[i] != t[i] : count += 1

print(count)

 

 

추천 많이 받은 풀이 by Ben Usman

s1 = 'GAGCCTACTAACGGGAT'
s2 = 'CATCGTAATGACGGCCT'
sum([a != b for a, b in zip(s1, s2)])

아니....진짜 왜이렇게 잘하는거야ㅠㅠㅠ

zip함수를 많이 사용해 봐야겠다

 

| R

a <- readLines("./CPM.txt")

a2 <- a %>% strsplit("") 
l1 <- a2[[1]]
l2 <- a2[[2]]

out <- 0
for (i in 1:length(l1)){
  if(l1[i] != l2[i]){
    out <- out + 1
  }
}
out