Question
pcr primer와 adapter에 차이가 있나요? 둘 다 서열 증폭과정에 이용되는 인공적인 서열 아닌가요?
Answer
Both PCR primers and sequence adaptors are artificial DNA oligonucleotides, generally of known sequence.
>> 둘 다 인공적으로 만들어진 DNA oligonucleotides 인것은 맞다
The first are used to prime DNA replication reactions.
Those used to amplify specific DNA sequences in vitro are called PCR primers.
>> PCR primers는 시험관 내에서 특정 DNA서열을 증폭하는 데 사용된다
Sequence adaptors are any kind of short DNA sequence serving the scope of fishing a (generally unknown) DNA sequence of interest for various purposes; they are used in a variety of techniques, and sometimes can take part in a DNA replication step (e.g. in a 5'RACE).
>> Sequence adaptors 는 여러목적으로 만들어진 종류의 짧은 DNA서열을 말하며 DNA복제 과정에서 사용되기도 한다
>> adapter( = adaptor) 란 NGS 장비가 인식할 수 있는 고유한 염기서열을 가진 oligonucleotides, 이 후 PCR -> 정제를 거쳐 library 제작하게 된다
Depending on experimental protocols and following bioinformatics, both PCR primers and sequence adaptors can end up in raw sequence reads (for instance, this may occur if you are sequencing a DNA library).
>> 실험적 과정에 따라 둘 다 결국 raw sequence read가 된다.
